Il bisogno soddisfa la necessità degli stakeholder di progettare delle strategie di identificazione di animali bassi ed alti emettitori da test molecolari rapidi e sicuri, basati sull’identificazione di specie batteriche correlate con le emissioni. Il microbiota può essere modulato tramite l’alimentazione e la conoscenza di quali specie sono correlate con la produzione di metano può risultare utile per sviluppare delle strategie alimentari efficaci. I risultati possono anche essere utili per ana

L’obiettivo del task è quello di caratterizzare la genetica degli animali a bassa ed alta produzione di metano. In questo task UNITUS ha collaborato con il task 5.3.6 per la caratterizzazione del microbiota in bufale a bassa e alta emissione di metano, al fine di identificare specie batteriche correlate con la produzione di metano stesso. In particolare, il task 5.3.6 si è occupato dalla raccolta del materiale biologico (fecale) e delle misurazioni di metano. UNITUS ha sviluppato e ottimizzato gli approcci sperimentali e computazionali per l’analisi di caratterizzazione del microbiota, che è avvenuta tramite il sequenziamento del gene marcatore 16S con tecnologia illumina. L’attività sperimentale è stata condotta ottimizzando le procedure di estrazione del DNA, assieme a una valutazione della sua qualità e l’amplificazione delle regioni V3-V5 del gene marcatore 16S. L’aspetto computazionale ha riguardato lo sviluppo di una pipeline, che può essere eseguita in ambiente HPC (High Performance Computing), in grado di classificare le specie batteriche, eseguendo le analisi statistiche che possono fornire indicazioni sui batteri correlati alla produzione di metano.

Il target del servizio i Ricercatori, il Settore privato (ad esempio del settore mangimistico) e i Policy maker.