| TITOLO SOLUZIONE | Diversità genetica in finocchio e identificazione di marcatori associati a tratti di interesse |
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| Ente | Università di Padova |
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| Quale bisogno soddisfa | Lo studio ha permesso di decifrare per la prima volta la diversità genetica di finocchio esistente a livello globale e di studiare il potenziale genetico celato all'interno delle pochissime collezioni esistenti per implementare programmi di breeding. Inoltre lo studio di associazione genotipo-metabolita ha consentito l'identificazione di geni candidati putativamente coinvolti nella produzione di composti volatili dal potenziale interesse farmaceutico, tra cui il l'anetolo.
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| Descrizione | Analisi della diversità genetica esistente a livello mondiale in finocchio ed identificazione di marcatori molecolari associati a tratti di interesse.
Il genoma di finocchio è stato assemblato per la prima volta in cromosomi. Cento accessioni di finocchio provenienti da tutto il mondo ed appartenenti alle due principali sottospecie cioè piperitum e vulgare (quest'ultima a sua volta divisa in var. azoricum e var. dulce) sono state sottoposte a WGS (coverage medio 15-20×) ed analisi metabolomiche (per identificare i chemotipi "anethole-type" ed "estragole-type"). L'analisi delle varianti genetiche ha permesso di studiare la diversità genetica da un punto di vista geografico, tassonomico e chemotipico. L'integrazione di dati genomici e metabolici ha permesso condurre un'analisi GWAS per identificare i geni chiave coinvolti nella produzione dei suddetti composti.
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| Numero Task | 1.1.1 |
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| Titolo Task | Genome wide analysis of genetic diversity, pan - genome reconstruction and modeling of evolvability in response to CC |
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| Docente di riferimento | Fabio |
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| Palumbo |
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| Email | Email nascosta; è necessario JavaScript. |
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| Abstract grafico della soluzione |  |
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| Gruppo di lavoro con tutti i ricercatori ed enti coinvolti | Spoke 1
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| Nome | Gabriele |
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| Cognome | Magon |
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| Email | Email nascosta; è necessario JavaScript. |
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| Ente | Università di Padova |
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| Nome | Giovanni |
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| Cognome | Gabelli |
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| Email | Email nascosta; è necessario JavaScript. |
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| Email | Università di Padova |
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| Task leader | Matteo dell'Acqua / Marco Maccafferri |
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| WP leader | Silvio Salvi / Sara pegolo |
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| TRL iniziale | 2 |
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| TRL attuale | 4 |
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| TRL finale | 4 |