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TITOLO SOLUZIONEDiversità genetica in finocchio e identificazione di marcatori associati a tratti di interesse
EnteUniversità di Padova
Quale bisogno soddisfa

Lo studio ha permesso di decifrare per la prima volta la diversità genetica di finocchio esistente a livello globale e di studiare il potenziale genetico celato all'interno delle pochissime collezioni esistenti per implementare programmi di breeding. Inoltre lo studio di associazione genotipo-metabolita ha consentito l'identificazione di geni candidati putativamente coinvolti nella produzione di composti volatili dal potenziale interesse farmaceutico, tra cui il l'anetolo.

Descrizione

Analisi della diversità genetica esistente a livello mondiale in finocchio ed identificazione di marcatori molecolari associati a tratti di interesse.
Il genoma di finocchio è stato assemblato per la prima volta in cromosomi. Cento accessioni di finocchio provenienti da tutto il mondo ed appartenenti alle due principali sottospecie cioè piperitum e vulgare (quest'ultima a sua volta divisa in var. azoricum e var. dulce) sono state sottoposte a WGS (coverage medio 15-20×) ed analisi metabolomiche (per identificare i chemotipi "anethole-type" ed "estragole-type"). L'analisi delle varianti genetiche ha permesso di studiare la diversità genetica da un punto di vista geografico, tassonomico e chemotipico. L'integrazione di dati genomici e metabolici ha permesso condurre un'analisi GWAS per identificare i geni chiave coinvolti nella produzione dei suddetti composti.

Numero Task1.1.1
Titolo TaskGenome wide analysis of genetic diversity, pan - genome reconstruction and modeling of evolvability in response to CC
Docente di riferimentoFabio
Palumbo
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Abstract grafico della soluzioneAbstract grafico della soluzione
Gruppo di lavoro con tutti i ricercatori ed enti coinvolti

Spoke 1

NomeGabriele
CognomeMagon
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EnteUniversità di Padova
NomeGiovanni
CognomeGabelli
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EmailUniversità di Padova
Task leaderMatteo dell'Acqua / Marco Maccafferri
WP leaderSilvio Salvi / Sara pegolo
TRL iniziale2
TRL attuale4
TRL finale4